关于本项目

项目简介

Bioinfo-SMU 是一个面向南方医科大学生物信息学专业学生的学习资源库。

项目宗旨

帮助生信专业的同学们更好地学习和科研，共同进步！

我们相信：

  • 知识共享能让学习更高效
  • 互帮互助能让进步更快速
  • 开源协作能创造更大价值

项目目标

为学生提供

  1. 全面的课程资料
    • 各门专业课的实验代码
    • 详细的实验报告和笔记
    • 考试复习资料
  2. 系统的学习路线
    • 从入门到精通的学习指导
    • 各阶段的重点和难点
    • 推荐的学习资源
  3. 实用的科研工具
    • 常用生物信息学分析脚本
    • 数据处理和可视化代码
    • 最佳实践和经验分享

培养能力

  • 编程能力 - R 和 Python 编程技能
  • 数据分析 - 生物数据的统计分析能力
  • 科研思维 - 独立思考和解决问题的能力
  • 协作精神 - 开源协作和知识分享

项目维护

创始人

Nan He (@Hinna0818)

  • 邮箱：hinna01@163.com

贡献者

感谢所有为本项目做出贡献的同学！

查看完整贡献者列表 →

项目统计

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项目历程

2025

  • 12月 - 项目创建，添加大四计算生物学课程资料
  • 12月 - 建立 MkDocs 文档网站
  • 12月 - 完善学习路线和贡献指南

(持续更新中…)

技术栈

编程语言

  • R - 生物信息学数据分析主要语言
  • Python - 通用编程和机器学习
  • Markdown - 文档编写

工具和框架

  • MkDocs Material - 文档网站生成
  • Git & GitHub - 版本控制和协作
  • RStudio - R 语言开发环境
  • Jupyter Notebook - 交互式编程

主要 R 包

  • WGCNA - 加权基因共表达网络分析
  • igraph - 网络分析和可视化
  • DESeq2 - 差异表达分析
  • clusterProfiler - 功能富集分析
  • ggplot2 - 数据可视化

许可证

本项目采用 MIT License 开源协议。

MIT License 特点

  • 允许商业使用
  • 允许修改和分发
  • 允许私人使用
  • 需保留版权声明
  • 不提供任何担保

查看完整许可证 →

相关链接

官方资源

学习资源

数据库

  • GEO - 基因表达数据
  • TCGA - 癌症基因组数据
  • STRING - 蛋白质相互作用
  • KEGG - 代谢通路

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在线交流

直接联系

常见问题

谁可以使用这个项目？

任何对生物信息学感兴趣的人都可以使用，但主要面向南方医科大学的学生。

如何贡献资料？

请参考 贡献指南 了解详细步骤。

资料可以用于商业用途吗？

可以，但需要遵守 MIT License 的规定，保留版权声明。

发现错误怎么办？

请在 Issues 中报告，或直接提交 PR 修复。

可以转载项目内容吗？

可以，但请注明出处并遵守开源协议。

致谢

特别感谢

  • 南方医科大学生物信息学系的老师们
  • 所有贡献资料和代码的同学们
  • 所有 Star 和 Fork 本项目的朋友们

使用的开源项目

未来计划

  • [] 添加更多课程的学习资料
  • [] 建立在线交流社区
  • [] 制作视频教程
  • [] 举办线上/线下学习交流会
  • [] 建立题库和练习系统
  • [] 开发配套工具和脚本库

如果这个项目对你有帮助

请给我们一个 Star！

这是对我们最大的鼓励和支持！


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